Adição do READ_ME e do shell script, embora tenha bug com o comando python estudando solução

python/READ_ME.md

+# Estação Biométrica
+
+Centro de Tecnologia Acadêmica - UFRGS
+http://cta.if.ufrgs.br
+
+Licença: GPL v3
+Autor: Béuren F. Bechlin
+
+## Documentação de uso
+
+### Arduino
+
+Inicialmente é necessário fazer upload do sketch biometrica.ino para seu micro-
+controlador arduino.
+
+### Python
+
+Para o perfeito funcionamento dos algoritmos é necessário ter um interpretador
+de python com pelo menos a versão 2.7 instalada em sua máquina. Além disso,
+alguns módulos de python são necessários:
+
+* python-scipy
+* python-tk (tkInter)
+* python-matplotlib
+* python-sys
+* python-serial
+* python-Image
+* python-time
+* python-os
+
+#### Armazenamento.py
+
+Programa para aquisição dos dados do Arduino salvando-os em um arquivo .log.
+
+Este programa é utilizado com o programa biometrica.ino no qual a taxa de
+amostragem é definida no microcontrolador.
+
+Ordem de argumentos : [porta],[taxa_transmissão],[arquivo_saída]
+Onde:
+1. porta: porta serial no qual o arduino está conectado
+2. taxa_transmissão: velocidade de comunicação serial
+3. arquivo_saída: nome do arquivo em que os dados serão salvos
+4. tempo_de_execução: tempo total de execução, em segundos
+
+PADRÃO NOME DO ARQUIVO DE SAÍDA: coleta_[Nome]_[Sobrenome]_[obs].log
+[obs] são observações caso sejam necessárias
+
+Lembrando também que a taxa de transmissão(Baud Rate) da comunicação serial tem
+de ser multiplo par de 300. Exemplo 1200, 9600.
+
+#### Visualiza.py
+
+Programa que estima e emite um relatório sobre a frequência respiratória.
+
+Ordem de argumentos : [arquivo_entrada], [instante inicial], [instante final],
+[tipo do filtro], [repetições], [freq_inicial], [freq_final]
+
+Onde:
+
+-Evidenciando arquivo onde estão os dados a serem anilizado/exibidos:
+1. arquivo_entrada: arquivo que será visualizado/analisado.
+
+-Determinando em que ponto da amostra quer ser analizado:
+2. instante inicial(s): instante para iniciar a visualização/analise.
+3. instante final(s): instante para finalizar a visualização/analise.
+
+-Escolhendo filtro apropriado:
+4. tipo do filtro: escolher o filtro a ser utilizado no processo. (1 ou 2)
+5. repetições: definir a quantidade de vezes que o filtro será utilizado.
+
+-Definindo o espectro de frequência a se uso:
+6. freq_inicial(Hz): definir a frequência inicial positiva que será usada, isso
+influenciará na precisão do resultado para o método.
+7. freq_final(Hz): definir a frequência final positiva que será usada, lembrando
+que pela definição de transformada de fourier o domínio do espectro de frequência
+não será maior que a frequência de obtenção desses dados divido por 2, ou seja,
+a as frequências definidas aqui devem estar no intervalo [0;freq/2].

python/armazenamento_new.py

@@ -29,6 +29,9 @@ argumento = sys.argv[1:] #renomeando os argumentos
 baud_rate = [300, 1200, 2400, 4800, 9600, 14400, 19200, 28800, 38400, 57600, 115200]
 baud_correct = 0
 # Erros
+if len(sys.argv) < 4:
+    sys.stderr.write('ERRO: Argumentos insuficientes.\nEm caso de dúvidas leia o READ_ME.md.\n' )
+    sys.exit(1)
 if not os.path.exists(argumento[0]):
 	sys.stderr.write('ERRO: Arduino não está conectado na porta '+argumento[0]+'!\nEm caso de dúvidas leia o READ_ME.md.\n')
 	sys.exit(1)
@@ -42,6 +45,7 @@ if not baud_correct:
     sys.stderr.write('ERRO: A taxa de transmissão '+argumento[1]+' não pode ser usada pelo microcontrolador!\nEm caso de dúvidas leia o READ_ME.md.\n')
     sys.exit(1)
 
+
 # Iniciando comunicação serial
 ser = serial.Serial(argumento[0], argumento[1])
 # Limpando buffer para retirar as medidas feitas antes de iniciar o software

python/coleta_demo.sh

+#!/bin/bash
+# Script Biometrica
+
+if [ $# -eq 0 ] ; then
+    echo 'ERRO: Faltam argumentos.\nPor favor inicie novamente e passe os argumentos na ordem\n[PORTA_USB] [NOME_SAÍDA] [TEMPO]'
+    exit 1
+fi
+usb_port=$1
+log_file=$2
+log_file="$log_file.log"
+time=$3 
+echo "Bem Vindo!\n Esse script realiza o processo padrão para estimar a frequência respiratória."
+echo "Dados usados:\n PORTA USB = $usb_port\tNOME DO ARQUIVO = $log_file\tTEMPO DO EXERCÍCIO = $time s"
+echo "Iniciando em: \n3..."
+sleep 1
+echo "2..."
+sleep 1
+echo "1..."
+sleep 1
+
+echo "python armazenamento_new.py $usb_port 115200 $logfile $time"
+
+python armazenamento_new.py $usb_port 115200 $logfile $time
+
+if [ -f "$log_file" ]
+then
+	echo "DADOS FORAM ARMAZENADOS COM SUCESSO! \n Iniciando algoritmo para o relatório."
+	python visualiza_new.py $log_file 0 $time 2 4 0 1
+else
+	echo "ERRO! Não foi possivel realizar as operações"
+fi
+