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fisiolog
respirometro
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c79f2a17
Commit
c79f2a17
authored
Sep 30, 2014
by
beuren
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Alteração arquivo visualização
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9a67213b
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visualiza.py
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c79f2a17
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
#!/usr/bin/env python
# -*- coding: utf-8 -*-
#
# Visualizador de dados da estação biométrica
#
# Centro de Tecnologia Acadêmica - UFRGS
# http://cta.if.ufrgs.br
# Visualizador de Temperatura
#
# Licença: GPL v3
from
matplotlib
import
pyplot
as
plt
import
numpy
as
np
import
sys
#Ordem de parametros : [arquivo], [real_time(-R)]
from
pylab
import
*
import
time
,
sys
parametro
=
sys
.
argv
[
1
:]
#try:
# filename = sys.argv[1]
# except:
# print 'Necessário fornecer um parâmetro: nome do arquivo'
# sys.exit(1)
ion
()
fisiologfile
=
open
(
parametro
[
0
]
+
'.log'
,
'r'
)
i
=
0
t
=
[]
h
=
[]
for
linha
in
fisiologfile
:
if
linha
[
0
]
==
'!'
:
frequencia
=
linha
.
strip
(
'!'
)
periodo
=
1.0
/
frequencia
elif
linha
[
0
]
!=
'#'
:
h
.
append
(
float
(
linha
.
split
(
'
\t
'
)[
1
]))
t
.
append
(
i
)
i
=
i
+
periodo
fisiologfile
.
close
()
fisiologfile
=
open
(
parametro
[
0
]
+
'.log'
,
'r'
)
fig
=
figure
(
1
)
sub
=
subplot
(
111
)
x
=
[]
y
=
[]
line
=
plot
(
t
,
h
,
'r-'
)
for
line
in
fisiologfile
:
line
=
line
.
strip
()
if
line
[
0
]
!=
"#"
:
aux
=
line
.
split
(
'
\t
'
)
x
.
append
(
aux
[
0
][
-
5
:
-
3
])
y
.
append
(
aux
[
1
])
xlabel
(
'Tempo(s)'
)
ylabel
(
''
)
title
(
'Frequência Respiratória'
)
plt
.
plot
(
x
,
y
)
#Variáveis de controle
intervalo
=
5
quantidade_dados
=
int
(
intervalo
*
frequencia
(
3
/
2
))
variacao
=
0.02
#porcento
variacao_max
=
0.20
#porcento
plt
.
title
(
"Plot exemplo"
)
plt
.
xlabel
(
"Tempo"
)
plt
.
ylabel
(
"Freq."
)
#Inicialização de variáveis
x0
=
0
plt
.
show
()
while
True
:
try
:
t0
=
time
.
time
()
#Leitura do ultimo dado do arquivo (Problema se o arquivo não estiver sendo atualizado)
fisiologfile
=
open
(
parametro
[
0
]
+
'.log'
,
'r'
)
s
=
fisiologfile
.
readlines
()[
-
1
].
split
(
'
\t
'
)[
1
]
t
.
append
(
i
)
h
.
append
(
s
)
line
[
0
].
set_data
(
t
,
h
)
x0
=
i
-
intervalo
sub
.
set_xlim
(
x0
,
i
)
#Controle do foco da imagem do gráfico
yf
=
(
1.0
+
variacao_y
)
*
(
max
(
h
[
-
quantidade_dados
:]))
yi
=
(
1.0
-
variacao_y
)
*
(
min
(
h
[
-
quantidade_dados
:]))
valor_medio
=
sum
(
h
[
-
quantidade_dados
:])
/
quantidade_dados
if
(
yf
>
(
1
+
variacao
+
variacao_max
)
*
valor_medio
):
yf
=
(
1
+
variacao
+
variacao_max
)
*
valor_medio
if
(
yi
<
(
1
-
variacao
-
variacao_max
)
*
valor_medio
):
yi
=
(
1
-
variacao
-
variacao_max
)
*
valor_medio
sub
.
set_ylim
(
yi
,
yf
)
draw
()
i
=
i
+
periodo
if
(
periodo
-
(
time
.
time
()
-
t0
))
<
0
:
print
"Não é possível operar a essa frequência"
break
fisiologfile
.
close
()
time
.
sleep
(
periodo
-
(
time
.
time
()
-
t0
))
except
KeyboardInterrupt
:
break
except
ValueError
:
print
"Não é possível operar a essa frequência (controlador)"
break
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