VER_0.0.01: onde temos o armazenamento dos dados e o algoritmo para estimar a...

VER_0.0.01: onde temos o armazenamento dos dados e o algoritmo para estimar a frequência respiratório com saída em .png

python/armazenamento_new.py

+#!/usr/bin/env python
+# -*- coding: utf-8 -*-
+'''
+ Estação biométrica CTA
+
+ Programa para aquisição dos dados
+ Este programa é utilizado com o programa biometrica.ino no qual a taxa de amostragem é definida no microcontrolador
+
+ Protocolo usado está disponível no biométrica.ino
+
+ Centro de Tecnologia Acadêmica - UFRGS
+ http://cta.if.ufrgs.br
+
+ Licença: GPL v3
+ Ordem de argumentos : [porta],[taxa_transmissão],[arquivo_saída]
+ Onde:
+	[porta]: porta serial no qual o arduino está conectado
+	[taxa_transmissão]: velocidade de comunicação serial
+	[arquivo_saída]: nome do arquivo em que os dados serão salvos
+	[tempo_de_execução]: tempo total de execução, em segundos
+
+	PADRÃO NOME DO ARQUIVO DE SAÍDA: coleta_[Nome]_[Sobrenome]_[obs].log
+		[obs] são observações caso sejam necessárias
+'''
+# Exemplo: python armazenamento.py '/dev/ttyACM0' 115200 coleta_Nome_Exemplo_1min.log 30
+
+import sys, time, serial, datetime
+argumento = sys.argv[1:] #renomeando os argumentos
+
+# Iniciando comunicação serial
+ser = serial.Serial(argumento[0], argumento[1])
+# Limpando buffer para retirar as medidas feitas antes de iniciar o software
+ser.setDTR(False)	# Desliga DTR
+time.sleep(0.005)
+ser.flushInput()	# Limpa buffer de dados
+ser.setDTR(True)  # Liga DTR novamente
+
+# Variáveis de controle
+frequencia = int(ser.readline().replace('\r\n',''))
+
+# Arquivos de log
+fisiologfile = open(argumento[2],'w')
+now=datetime.datetime.now()
+fisiologfile.write(now.strftime("#Frequência\t"+str(frequencia)+"\t(Hz)\n"+"#Estação Biométrica\n"+"#Coleta de dados iniciado em: "+"%Y-%m-%d %H:%M:%S" +"\n"+"#Protocolo usado: a primeira coluna é a medida do primeiro termistor e a segunda do segundo.\n"))
+fisiologfile.close()
+
+print "Data e hora da medida \t\tMedida 1\tMedida 2"
+time = int(argumento[3])*frequencia
+time_counter = 0;
+while (time_counter <= time or time == 0):
+	time_counter += 1
+	print time, time_counter
+	try:
+		option = ser.read()
+		# Respiração
+		# 	Para o python '\x' serve para representar uma caracter HEX ASCII
+		# 	e o 0x para para valores HEX literais. O comando write do arduino
+		#	  envia um caracter, logo deve-se usar a primeira forma
+		if option == "\x0A":
+
+			sensor_value1 = ser.readline().replace('\r\n','')
+			sensor_value2 = ser.readline().replace('\r\n','')
+
+			# Arquivo de log
+			fisiologfile = open(argumento[2],'a')
+			fisiologfile.write(str(sensor_value1)+"\t"+str(sensor_value2)+"\n")
+			fisiologfile.close()
+
+			# Registra horário atual
+			now = datetime.datetime.now()
+
+			# Mostrando dados na tela
+			print now.strftime("%Y-%m-%d %H:%M:%S.%f")[:-3],"\t", sensor_value1, "\t\t", sensor_value2
+
+		# Erro 1
+		if option == '\x01':
+			print 'Frequência muito alta para o microcontrolador: ', frequencia, '. Finalizando processo.\n'
+
+	except KeyboardInterrupt:
+				break
+
+ser.close()

python/coleta_Nome_Exemplo_1min.log

+#Frequência\x0915\x09(Hz)
+#Estação Biométrica
+#Coleta de dados iniciado em: 2015-03-13 16:52:24
+#Protocolo usado: a primeira coluna é a medida do primeiro termistor e a segunda do segundo.
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